Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP5C1P36542 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms