Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYH11P35749 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYH11P35749 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYH11P35749 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYH11P35749 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYH11P35749 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYH11P35749 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYH11P35749 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYH11P35749 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYH11P35749 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms