Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA4P35212 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA4P35212 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA4P35212 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJA4P35212 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJA4P35212 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJA4P35212 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA4P35212 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA4P35212 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJA4P35212 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms