Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPC1P35052 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPC1P35052 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPC1P35052 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPC1P35052 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms