Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC12P31275 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms