Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA13P31271 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA13P31271 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms