Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECHS1P30084 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms