Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD40LGP29965 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms