Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP1P29466 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP1P29466 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP1P29466 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP1P29466 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP1P29466 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP1P29466 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP1P29466 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms