Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD34P28906 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD34P28906 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD34P28906 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD34P28906 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD34P28906 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD34P28906 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD34P28906 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD34P28906 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD34P28906 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms