Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLD1P28340 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLD1P28340 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLD1P28340 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLD1P28340 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POLD1P28340 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLD1P28340 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLD1P28340 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
POLD1P28340 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLD1P28340 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLD1P28340 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLD1P28340 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLD1P28340 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLD1P28340 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms