Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKBIAP25963 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms