Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTSSP25774 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTSSP25774 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms