Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTAFRP25105 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTAFRP25105 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms