Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms