Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD247P20963 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD247P20963 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD247P20963 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD247P20963 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD247P20963 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD247P20963 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD247P20963 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD247P20963 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD247P20963 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms