Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI1P19237 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNI1P19237 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms