Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MS4A1P11836 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A1P11836 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms