Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
DMDP11532 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DMDP11532 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DMDP11532 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DMDP11532 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DMDP11532 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DMDP11532 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms