Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRFP10586 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRFP10586 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms