Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM17P0DL12 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SMIM17P0DL12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms