Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUDT3O95989 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUDT3O95989 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms