Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POP4O95707 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POP4O95707 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP4O95707 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP4O95707 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP4O95707 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POP4O95707 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP4O95707 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms