Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FLOT1O75955 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FLOT1O75955 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms