Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDIL3O43854 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
EDIL3O43854 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDIL3O43854 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms