Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms