Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA3O43365 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA3O43365 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms