Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHADO15335 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHADO15335 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHADO15335 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHADO15335 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHADO15335 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHADO15335 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHADO15335 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHADO15335 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHADO15335 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHADO15335 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHADO15335 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHADO15335 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHADO15335 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHADO15335 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms