Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPHP1O15259 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPHP1O15259 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms