Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM6BO15054 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM6BO15054 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms