Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SETD1AO15047 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms