Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PIK3C2AO00443 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PIK3C2AO00443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PIK3C2AO00443 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms