Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARVCFO00192 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARVCFO00192 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARVCFO00192 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms