Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT4C9JH25 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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