Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF3BA8MYP8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3BA8MYP8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms