Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM3A6NNA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRRM3A6NNA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRRM3A6NNA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRRM3A6NNA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms