Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCNX2A6NKB5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCNX2A6NKB5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms