Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.654e-17■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.663e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 C1QTNF3-205ENST00000513065 421 ntTSL 34.47□□□□□ -1.695e-8■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 YIPF4-202ENST00000437765 728 ntTSL 54.15□□□□□ -1.753e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 IL1R1-210ENST00000430171 709 ntTSL 33.79□□□□□ -1.81e-5■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ATG2B-204ENST00000488421 522 ntTSL 43.71□□□□□ -1.823e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 ATG2B-203ENST00000473234 550 ntTSL 42.89□□□□□ -1.953e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 RSL1D1-210ENST00000573791 520 ntTSL 42.52□□□□□ -2.013e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 IL1R1-207ENST00000422532 574 ntTSL 52.45□□□□□ -2.023e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 32.35□□□□□ -2.033e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PHYKPL-211ENST00000494126 2297 ntTSL 1 (best)25.47■■□□□ 1.674e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PHYKPL-209ENST00000489262 2780 ntTSL 222.1■■□□□ 1.134e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PHYKPL-204ENST00000474052 1539 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.14e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 218.35■□□□□ 0.534e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.344e-11■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.54e-11■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.8□□□□□ -14e-11■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.634e-11■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 NADSYN1-208ENST00000527227 799 ntTSL 318.55■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 219.47■□□□□ 0.712e-6■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT2-225ENST00000457874 484 ntTSL 35.63□□□□□ -1.516e-18■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 25.38□□□□□ -1.556e-18■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 SEPT2-236ENST00000476841 304 ntTSL 35.1□□□□□ -1.596e-18■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.438e-7■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 FASTK-210ENST00000478477 826 ntTSL 315.85■□□□□ 0.134e-9■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 PA2G4-203ENST00000551061 694 ntTSL 23.91□□□□□ -1.783e-19■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.178e-9■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.338e-9■□□□□ 11.1
EFTUD2Q15029 CSNK1D-206ENST00000577578 928 ntTSL 211.7□□□□□ -0.543e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.624e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 314.13□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.34e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 412.66□□□□□ -0.384e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 311.87□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.77□□□□□ -0.694e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 210.12□□□□□ -0.794e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.164e-7■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ARPC2-215ENST00000484961 722 ntTSL 315.19■□□□□ 0.021e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-204ENST00000528156 658 ntTSL 212.19□□□□□ -0.461e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-201ENST00000501011 607 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.561e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-203ENST00000527627 504 ntTSL 311.55□□□□□ -0.561e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-206ENST00000533528 340 ntTSL 59.32□□□□□ -0.921e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 RAB30-AS1-208ENST00000534499 597 ntTSL 28.99□□□□□ -0.971e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NRBP1-208ENST00000493746 515 ntTSL 55.87□□□□□ -1.471e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ARPC2-210ENST00000471355 602 ntTSL 24.89□□□□□ -1.631e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ARPC2-211ENST00000472753 503 ntTSL 32.78□□□□□ -1.961e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 ATF7IP2-218ENST00000570163 559 ntTSL 22.29□□□□□ -2.041e-9■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.662e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-220ENST00000513100 557 ntTSL 414.91□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-205ENST00000446294 2065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-201ENST00000257435 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-208ENST00000453526 559 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-212ENST00000505864 701 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-215ENST00000508161 475 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-213ENST00000507032 311 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-203ENST00000395634 1468 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-219ENST00000509979 771 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-222ENST00000514515 3564 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-210ENST00000503429 1079 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.712e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NREP-214ENST00000507742 577 ntTSL 23.34□□□□□ -1.872e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 214.15□□□□□ -0.144e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 213.42□□□□□ -0.264e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 510.99□□□□□ -0.654e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 310.46□□□□□ -0.734e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 LARP4B-205ENST00000448368 1438 ntTSL 422.2■■□□□ 1.142e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 LARP4B-210ENST00000609318 4848 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.692e-8■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-212ENST00000483451 1119 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 518.48■□□□□ 0.552e-13■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-13■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 516.87■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-211ENST00000481136 674 ntTSL 210.7□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-217ENST00000494502 757 ntTSL 58.09□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-209ENST00000475915 849 ntTSL 54.81□□□□□ -1.642e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-215ENST00000492139 686 ntTSL 54.08□□□□□ -1.762e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-205ENST00000464360 585 ntTSL 34.02□□□□□ -1.772e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 23.37□□□□□ -1.872e-13■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.92e-6■□□□□ 11
EFTUD2Q15029 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.446e-18■□□□□ 11
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3862.8 ms