Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUBP2Q9Y5Y2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms