Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP16Q9Y5T5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms