Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms