Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FARSAQ9Y285 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FARSAQ9Y285 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms