Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRRM2Q9UQ35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRRM2Q9UQ35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms