Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABT1Q9ULW3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABT1Q9ULW3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms