Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMFRQ9UKV5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMFRQ9UKV5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms