Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DBF4Q9UBU7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DBF4Q9UBU7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms