Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
MBD5Q9P267 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MBD5Q9P267 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MBD5Q9P267 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms