Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
CCDC180Q9P1Z9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
CCDC180Q9P1Z9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms