Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMG20BQ9P0W2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms