Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CXXC1Q9P0U4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXXC1Q9P0U4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms